經(jīng)過采收加工，吳茱萸的果實(shí)就成為了有藥用價(jià)值的中藥吳茱萸。它行為熱、辛、苦，帶有一點(diǎn)點(diǎn)小毒，歸于肝、脾、胃、腎經(jīng)。

1、它的功能主治。吳茱萸可以散寒止痛，降逆止嘔，助陽止瀉。經(jīng)常是用于厥陰頭痛，寒疝腹痛，寒濕腳氣的治療，對經(jīng)行腹痛，脘腹脹痛，嘔吐吞酸，五更泄瀉、高血壓也有顯著的療效。同時(shí)，它還可以外治口瘡、潰瘍、牙齒痛、濕疹等。內(nèi)服的話可以是煎湯、入丸、制散，外用可以研末調(diào)敷或者煎水洗，也可以蒸熱熨，方法多種。

2、它可以驅(qū)蛔蟲和抗菌。吳茱萸醇提物對蛔蟲有明顯的作用，而用它的煎劑經(jīng)過試驗(yàn)對霍亂弧菌有非常強(qiáng)的抑制功效，用吳茱萸的水浸劑還可以對絮狀表皮癬菌和奧杜盎氏小芽胞癬菌等11種皮膚真菌有不同程度的作用。

3、它對神經(jīng)系統(tǒng)有調(diào)節(jié)作用。吳茱萸對中樞神經(jīng)有興奮作用，還有增加頸動脈血流量，它的醇提物有鎮(zhèn)痛的功效，有一種吳茱萸提出生物堿還有鎮(zhèn)靜睡眠的作用。

4、它的用藥禁忌。吳茱萸有許多藥用作用，但是要注意不是每一個(gè)人都可以服用。其中以陰虛火旺的人為主不能使用，例如《綱目》所言的走氣、動火、昏目、發(fā)瘡，脾胃虛弱冒暑的人都是不可以服用的。

吳茱萸可以和大棗、當(dāng)歸、黨參、生姜、茴香等搭配服用，有針對性的治療各種病癥。當(dāng)然，我們應(yīng)該在醫(yī)生的指導(dǎo)下服用藥物，才可以保證效果和用量安全。